MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halophilic archaeon DL31 plasmid phalar01

Total Repeats: 15490

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015955	AG	3	6	21	26	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015955	CGA	2	6	44	49	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006828
3	NC_015955	AG	3	6	203	208	50 %	0 %	50 %	0 %	345006828
4	NC_015955	TCA	2	6	222	227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006828
5	NC_015955	ATC	2	6	291	296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006828
6	NC_015955	GAC	2	6	325	330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006828
7	NC_015955	TGC	2	6	403	408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006828
8	NC_015955	TCA	2	6	462	467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006828
9	NC_015955	TGGG	2	8	487	494	0 %	25 %	75 %	0 %	345006828
10	NC_015955	GTG	2	6	560	565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345006828
11	NC_015955	ACTT	2	8	615	622	25 %	50 %	0 %	25 %	345006828
12	NC_015955	TGA	2	6	637	642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006828
13	NC_015955	TTAT	2	8	694	701	25 %	75 %	0 %	0 %	345006828
14	NC_015955	CAA	2	6	738	743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345006828
15	NC_015955	AAT	2	6	922	927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015955	TAC	2	6	949	954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_015955	TC	3	6	1005	1010	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_015955	ACC	2	6	1087	1092	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_015955	ATA	2	6	1120	1125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015955	AAATGA	2	12	1137	1148	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015955	CAAC	2	8	1202	1209	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_015955	ATA	2	6	1263	1268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015955	GAT	2	6	1311	1316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015955	TATAT	2	10	1342	1351	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015955	GAG	2	6	1360	1365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015955	TA	3	6	1441	1446	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015955	AATC	2	8	1507	1514	50 %	25 %	0 %	25 %	345006829
28	NC_015955	TTC	2	6	1527	1532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345006829
29	NC_015955	T	6	6	1539	1544	0 %	100 %	0 %	0 %	345006829
30	NC_015955	GAA	2	6	1568	1573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345006829
31	NC_015955	CCTTT	2	10	1588	1597	0 %	60 %	0 %	40 %	345006829
32	NC_015955	AGC	2	6	1629	1634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006829
33	NC_015955	TTA	2	6	1700	1705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345006829
34	NC_015955	TAG	2	6	1751	1756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006829
35	NC_015955	TGC	2	6	1785	1790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006829
36	NC_015955	ATA	2	6	1813	1818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345006829
37	NC_015955	GAT	2	6	1845	1850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006829
38	NC_015955	CTT	2	6	1853	1858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345006829
39	NC_015955	TTG	2	6	1880	1885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345006829
40	NC_015955	TAA	2	6	1896	1901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345006829
41	NC_015955	T	6	6	1907	1912	0 %	100 %	0 %	0 %	345006829
42	NC_015955	AAT	2	6	2052	2057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345006829
43	NC_015955	TCT	2	6	2068	2073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345006829
44	NC_015955	ATA	2	6	2160	2165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015955	TTA	2	6	2183	2188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015955	GTA	2	6	2226	2231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015955	AT	3	6	2238	2243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015955	ATTT	2	8	2278	2285	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015955	TTC	2	6	2303	2308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345006830
50	NC_015955	AAT	2	6	2323	2328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345006830
51	NC_015955	TCA	2	6	2571	2576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006830
52	NC_015955	GCA	2	6	2577	2582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006830
53	NC_015955	AT	3	6	2678	2683	50 %	50 %	0 %	0 %	345006830
54	NC_015955	T	6	6	2706	2711	0 %	100 %	0 %	0 %	345006830
55	NC_015955	TAG	2	6	2720	2725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006830
56	NC_015955	CTT	2	6	2752	2757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345006830
57	NC_015955	TAAT	2	8	2785	2792	50 %	50 %	0 %	0 %	345006830
58	NC_015955	ATTT	2	8	2824	2831	25 %	75 %	0 %	0 %	345006830
59	NC_015955	AAAG	2	8	2867	2874	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015955	ATG	2	6	2891	2896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006831
61	NC_015955	TCGG	2	8	3019	3026	0 %	25 %	50 %	25 %	345006831
62	NC_015955	TTC	2	6	3031	3036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345006831
63	NC_015955	CAG	2	6	3074	3079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006831
64	NC_015955	AT	3	6	3105	3110	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015955	TCG	2	6	3233	3238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_015955	ATA	2	6	3313	3318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015955	AGT	2	6	3351	3356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015955	CGA	3	9	3448	3456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006832
69	NC_015955	CGC	2	6	3547	3552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345006832
70	NC_015955	TC	4	8	3666	3673	0 %	50 %	0 %	50 %	345006832
71	NC_015955	CAG	2	6	3767	3772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006832
72	NC_015955	CGC	2	6	3778	3783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345006832
73	NC_015955	ACC	2	6	3866	3871	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345006832
74	NC_015955	CCG	2	6	3877	3882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345006832
75	NC_015955	TTCC	2	8	3914	3921	0 %	50 %	0 %	50 %	345006832
76	NC_015955	GAC	3	9	3986	3994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006832
77	NC_015955	CCG	2	6	4035	4040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345006832
78	NC_015955	CTG	2	6	4055	4060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006832
79	NC_015955	GCC	2	6	4094	4099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345006832
80	NC_015955	GAT	2	6	4106	4111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006832
81	NC_015955	GAC	2	6	4127	4132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006832
82	NC_015955	GTC	2	6	4139	4144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006832
83	NC_015955	CGA	2	6	4180	4185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006832
84	NC_015955	ACC	2	6	4194	4199	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345006832
85	NC_015955	TCT	2	6	4257	4262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345006832
86	NC_015955	CGA	2	6	4300	4305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006832
87	NC_015955	GAA	2	6	4318	4323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345006832
88	NC_015955	GGA	2	6	4348	4353	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345006832
89	NC_015955	CG	3	6	4378	4383	0 %	0 %	50 %	50 %	345006832
90	NC_015955	GA	3	6	4387	4392	50 %	0 %	50 %	0 %	345006832
91	NC_015955	AGA	2	6	4401	4406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345006832
92	NC_015955	CGG	2	6	4457	4462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345006832
93	NC_015955	CAG	2	6	4593	4598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006832
94	NC_015955	TAC	2	6	4652	4657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006832
95	NC_015955	CGA	2	6	4669	4674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006832
96	NC_015955	TCT	2	6	4778	4783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345006833
97	NC_015955	CCCAT	2	10	4795	4804	20 %	20 %	0 %	60 %	345006833
98	NC_015955	GATG	2	8	4865	4872	25 %	25 %	50 %	0 %	345006833
99	NC_015955	CAT	2	6	4905	4910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006833
100	NC_015955	GCG	2	6	4997	5002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345006833
101	NC_015955	GGGT	2	8	5020	5027	0 %	25 %	75 %	0 %	345006833
102	NC_015955	CT	4	8	5121	5128	0 %	50 %	0 %	50 %	345006833
103	NC_015955	CAA	2	6	5140	5145	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345006833
104	NC_015955	GTT	2	6	5157	5162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345006833
105	NC_015955	TGAA	2	8	5169	5176	50 %	25 %	25 %	0 %	345006833
106	NC_015955	GAG	2	6	5221	5226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345006833
107	NC_015955	CAA	2	6	5307	5312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345006833
108	NC_015955	CCG	2	6	5387	5392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345006833
109	NC_015955	TTC	2	6	5423	5428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345006833
110	NC_015955	AAT	2	6	5494	5499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345006833
111	NC_015955	TAT	2	6	5526	5531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015955	ACT	2	6	5532	5537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_015955	GGT	2	6	5551	5556	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015955	GAC	2	6	5583	5588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_015955	GA	3	6	5590	5595	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015955	TCC	2	6	5619	5624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_015955	CAGT	2	8	5648	5655	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_015955	CAG	2	6	5661	5666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_015955	ATT	2	6	5686	5691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015955	AGC	2	6	5705	5710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_015955	A	6	6	5747	5752	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015955	CCA	2	6	5884	5889	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345006834
123	NC_015955	TGA	2	6	5924	5929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006834
124	NC_015955	GCCAC	2	10	5944	5953	20 %	0 %	20 %	60 %	345006834
125	NC_015955	CGA	2	6	5960	5965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006834
126	NC_015955	AC	3	6	6134	6139	50 %	0 %	0 %	50 %	345006835
127	NC_015955	TTG	2	6	6141	6146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345006835
128	NC_015955	TTA	2	6	6252	6257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345006835
129	NC_015955	TAA	2	6	6346	6351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345006835
130	NC_015955	CCA	2	6	6362	6367	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345006835
131	NC_015955	CTC	2	6	6379	6384	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345006835
132	NC_015955	CAA	2	6	6391	6396	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345006835
133	NC_015955	CTC	2	6	6449	6454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345006835
134	NC_015955	ACA	2	6	6509	6514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345006835
135	NC_015955	AG	4	8	6576	6583	50 %	0 %	50 %	0 %	345006835
136	NC_015955	GAA	2	6	6662	6667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345006835
137	NC_015955	AGA	2	6	6772	6777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345006835
138	NC_015955	AC	4	8	6779	6786	50 %	0 %	0 %	50 %	345006835
139	NC_015955	GCC	2	6	6852	6857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345006835
140	NC_015955	TCC	2	6	6882	6887	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345006835
141	NC_015955	CTA	2	6	6904	6909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006835
142	NC_015955	TCG	2	6	6978	6983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006835
143	NC_015955	A	6	6	7031	7036	100 %	0 %	0 %	0 %	345006835
144	NC_015955	GCTG	2	8	7088	7095	0 %	25 %	50 %	25 %	345006835
145	NC_015955	GCG	2	6	7125	7130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345006835
146	NC_015955	CAC	2	6	7145	7150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345006835
147	NC_015955	ATA	2	6	7203	7208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345006835
148	NC_015955	GAAC	2	8	7234	7241	50 %	0 %	25 %	25 %	345006835
149	NC_015955	CAT	2	6	7249	7254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006835
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151	NC_015955	TTC	2	6	7349	7354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345006835
152	NC_015955	AGA	2	6	7411	7416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345006835
153	NC_015955	GTA	2	6	7419	7424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006835
154	NC_015955	ACG	2	6	7467	7472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006835
155	NC_015955	ACG	2	6	7511	7516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006835
156	NC_015955	ACT	2	6	7609	7614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006835
157	NC_015955	CT	3	6	7737	7742	0 %	50 %	0 %	50 %	345006835
158	NC_015955	ACT	2	6	7747	7752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006835
159	NC_015955	GGA	2	6	7810	7815	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
160	NC_015955	GGTC	2	8	7857	7864	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
161	NC_015955	TC	3	6	7863	7868	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
162	NC_015955	TTCGG	2	10	7915	7924	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
163	NC_015955	A	6	6	8120	8125	100 %	0 %	0 %	0 %	345006836
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168	NC_015955	CAGA	2	8	8373	8380	50 %	0 %	25 %	25 %	345006836
169	NC_015955	TAC	2	6	8408	8413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006836
170	NC_015955	TC	3	6	8462	8467	0 %	50 %	0 %	50 %	345006836
171	NC_015955	CAG	2	6	8489	8494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006836
172	NC_015955	AAG	2	6	8544	8549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345006836
173	NC_015955	CT	3	6	8563	8568	0 %	50 %	0 %	50 %	345006836
174	NC_015955	GAT	2	6	8765	8770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006836
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176	NC_015955	TCAA	2	8	8781	8788	50 %	25 %	0 %	25 %	345006836
177	NC_015955	AAC	2	6	8790	8795	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345006836
178	NC_015955	TGT	2	6	8835	8840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345006836
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180	NC_015955	GTC	2	6	8892	8897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
181	NC_015955	GCC	2	6	8937	8942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
182	NC_015955	ATC	2	6	8946	8951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
183	NC_015955	ATG	2	6	8976	8981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
184	NC_015955	GATAA	2	10	8993	9002	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
185	NC_015955	GAC	2	6	9016	9021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
186	NC_015955	TGG	2	6	9034	9039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
187	NC_015955	TTA	2	6	9094	9099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
188	NC_015955	TGA	2	6	9132	9137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006837
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192	NC_015955	AG	3	6	9207	9212	50 %	0 %	50 %	0 %	345006837
193	NC_015955	TTTCC	2	10	9296	9305	0 %	60 %	0 %	40 %	345006837
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213	NC_015955	ATT	2	6	10206	10211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
214	NC_015955	TGA	2	6	10224	10229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
215	NC_015955	ATT	2	6	10420	10425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345006838
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222	NC_015955	CTG	2	6	10746	10751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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256	NC_015955	CAG	2	6	12516	12521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006839
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260	NC_015955	TAA	2	6	12709	12714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
261	NC_015955	ATC	2	6	12746	12751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
262	NC_015955	AAG	2	6	12789	12794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
263	NC_015955	GAA	2	6	12797	12802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
264	NC_015955	ATT	2	6	12860	12865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
265	NC_015955	ATA	2	6	12875	12880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
266	NC_015955	TTA	2	6	12897	12902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
267	NC_015955	TG	3	6	12909	12914	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
268	NC_015955	TCC	2	6	12999	13004	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345006840
269	NC_015955	CCCG	2	8	13114	13121	0 %	0 %	25 %	75 %	345006840
270	NC_015955	ACG	2	6	13131	13136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006840
271	NC_015955	TGA	2	6	13141	13146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006840
272	NC_015955	CAG	2	6	13184	13189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006840
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274	NC_015955	ACG	2	6	13239	13244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006840
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394	NC_015955	CCT	2	6	18478	18483	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345006842
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396	NC_015955	GA	3	6	18576	18581	50 %	0 %	50 %	0 %	345006842
397	NC_015955	GAG	2	6	18587	18592	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345006842
398	NC_015955	GAC	2	6	18629	18634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006842
399	NC_015955	ATG	2	6	18717	18722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006842
400	NC_015955	CGG	2	6	18854	18859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345006842
401	NC_015955	GAT	2	6	18871	18876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006842
402	NC_015955	TTC	2	6	18962	18967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345006842
403	NC_015955	ACT	2	6	18988	18993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006842
404	NC_015955	TCA	2	6	19026	19031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006842
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430	NC_015955	GGT	2	6	20096	20101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345006842
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432	NC_015955	AGA	2	6	20223	20228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345006842
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440	NC_015955	AAG	2	6	20667	20672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345006842
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